Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms