Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms