Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2Q9BSQ5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms