Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SLC39A3Q9BRY0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms