Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms