Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC43Q96MW1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms