Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPK3Q96L96 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms