Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms