Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms