Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms