Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E2Q96A05 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E2Q96A05 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms