Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms