Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms