Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 FZF1YGL254W 900 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 VEL1YGL258W 621 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 YPL113CYPL113C 1191 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 ROG1YGL144C 2058 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 GUS1YGL245W 2127 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 NUP133YKR082W 3474 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 YHL049CYHL049C 816 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 MSN1YOL116W 1149 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 YLR001CYLR001C 2589 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 THI20YOL055C 1656 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 SEC18YBR080C 2277 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 YIL169CYIL169C 2988 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 CIT1YNR001C 1440 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 TRE1YPL176C 2352 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 RRN11YML043C 1524 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 PDR3YBL005W 2931 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 NOP2YNL061W 1857 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 HEH2YDR458C 1992 nt4.59□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 YPR136CYPR136C 513 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 NUP85YJR042W 2235 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 PPZ1YML016C 2079 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 PEX18YHR160C 852 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 PSK2YOL045W 3306 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 YML037CYML037C 1023 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 ADD37YMR184W 597 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 TUM1YOR251C 915 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 YOR283WYOR283W 693 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 snR43snR43 209 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 XRN1YGL173C 4587 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 YPS6YIR039C 1614 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 RIM21YNL294C 1602 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 GCN5YGR252W 1320 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 SME1YOR159C 285 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 DIB1YPR082C 432 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 DDC1YPL194W 1839 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 RAD26YJR035W 3258 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 DAN4YJR151C 3486 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 ATP5YDR298C 639 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 BIO2YGR286C 1128 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 BMS1YPL217C 3552 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 SIR1YKR101W 1965 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 RSM24YDR175C 960 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 AIM25YJR100C 984 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 TOM40YMR203W 1164 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 PEX32YBR168W 1242 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 ARO10YDR380W 1908 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 PRP9YDL030W 1593 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 ABD1YBR236C 1311 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 TAF1YGR274C 3201 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 PRP28YDR243C 1767 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 YDR396WYDR396W 501 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 NIS1YNL078W 1224 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 PNG1YPL096W 1092 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 CWH41YGL027C 2502 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 YER084WYER084W 387 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 ERP6YGL002W 651 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 ATP4YPL078C 735 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 SPT23YKL020C 3249 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 ARO9YHR137W 1542 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-ORQ92393 CAX4YGR036C 720 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 PRX1YBL064C 786 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 RGC1YPR115W 3252 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 MMR1YLR190W 1476 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 BLM10YFL007W 6432 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YER134CYER134C 537 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 RPS21AYKR057W 264 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 ILS1YBL076C 3219 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 SMC6YLR383W 3345 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YPL109CYPL109C 1974 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 TMA108YIL137C 2841 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 GUF1YLR289W 1938 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 PMS1YNL082W 2622 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 PRS5YOL061W 1491 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 RNR2YJL026W 1200 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 RDL2YOR286W 450 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YFL040WYFL040W 1623 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 ZDS1YMR273C 2748 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YPK9YOR291W 4419 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 FRE7YOL152W 1863 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YPL150WYPL150W 2706 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 DCS1YLR270W 1053 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YLR297WYLR297W 390 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 DCV1YFR012W 609 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YIL175WYIL175W 318 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 CHA4YLR098C 1947 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 ESF1YDR365C 1887 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 CMR1YDL156W 1569 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 CSM3YMR048W 954 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 GRE1YPL223C 507 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YDL180WYDL180W 1644 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 SPO16YHR153C 597 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YDR186CYDR186C 2634 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 FKH1YIL131C 1455 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YKR070WYKR070W 1059 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-ORQ92393 YOR022CYOR022C 2148 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1B-ORQ92393 SPT6YGR116W 4356 nt4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 155.2 ms