Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29Q8TEQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms