Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAT3Q8TDW7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms