Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGRP4Q8TDF6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms