Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms