Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP11CQ8NB49 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms