Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ANKRD42Q8N9B4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms