Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms