Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms