Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms