Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms