Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms