Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC71Q8IV32 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC71Q8IV32 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms