Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHSY1Q86X52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms