Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms