Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms