Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1549LQ6ZVL6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms