Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms