Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms