Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC6Q6W4X9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms