Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF7IPQ6VMQ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms