Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms