Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms