Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD3Q6PCD5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms