Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3L3Q68CJ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms