Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms