Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4F1Q66K89 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms