Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN2Q63HK3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms