Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CC2D1BQ5T0F9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CC2D1BQ5T0F9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CC2D1BQ5T0F9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms