Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms