Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms