Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms