Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms