Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX19Q49B96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms