Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms