Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms