Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
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